БИОИНФОРМАЦИОННЫЙ ПОИСК И ПОСТРОЕНИЕ БАЗЫ ДАННЫХ ГЕНОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ С ВЫСОКИМ РИСКОМ РАЗВИТИЯ ЦЕРЕБРОВАСКУЛЯРНОЙ ПАТОЛОГИИ
Дергилева Александра Яковлевна
Студент кафедры биоинженерии и биоинформатики,
Волгоградский государственный университет
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
просп. Университетский, 100, 400062 г. Волгоград, Российская Федерация
Кишеневский Александр Михайлович
Аспирант кафедры биоинженерии и биоинформатики,
Волгоградский государственный университет
Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
просп. Университетский, 100, 400062 г. Волгоград, Российская Федерация
Аннотация. В работе рассматриваются основы патогенеза цереброваскулярных заболеваний, факторы риска, генетические аспекты формирования сосудистых заболеваний головного мозга и их зависимость от пенетрантности генетических полиморфизмов. Проведен биоинформационный поиск с использованием открытых ресурсов PubMed, SNP, Gene, KEGG, а также полнотекстовых версий статей в PubMedCentral и Научной электронной библиотеке Российского индекса цитирования (eLibrary). В процессе исследования был проведен анализ порядка 350 генов, задействованных в процессах, обусловливающих возникновение ЦВЗ. Эти гены были связаны с контролем
таких процессов, как вязкость и микроциркуляция крови; функция тромбоцитов и сосудистого эндотелия; макрофагальные и иммунные реакции; чувствительность нейронов к гипоксии; защитная функция нейроглии. Количество точечных полиморфизмов в каждом из найденных генов колебалось в пределах от 500 до 3 000.
Была создана модель для построения базы данных генетических полиморфизмов, ассоциированных с высоким риском развития цереброваскулярной патологии, которая позволяет составить полноценное представление о структуре генетических полиморфизмов, ассоциированных с высоким риском развития цереброваскулярной патологии. База данных имеет практическое применение, поскольку может быть использована для виртуального скрининга и последующего моделирования потенциальной эффективности SNP-полиморфизмов в качестве диагностических тест-систем по выявлению лиц, предрасположенных к сосудистым заболеваниям головного мозга.
Ключевые слова: ишемия мозга, инсульт, цереброваскулярная патология, генетический полиморфизм, базы данных.